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北京畜牧兽医研究所联合北京康普森成功研发“京芯一号mini”芯片和数字化肉鸡联合育种平台——引领育种技术快速发展
2024.08.18

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在现代农业科技的浪潮中,育种技术的创新已成为推动产业升级的关键力量。今天,我们要介绍的是由中国农业科学院北京畜牧兽医研究所与北京LETOU(乐投)技术有限公司联合推出的两大育种利器——“京芯一号mini”芯片和数字化肉鸡联合育种平台。这两项技术的联袂登场,预示着我国肉鸡育种产业即将迎来一个新的里程碑。


“京芯一号”的诞生可以追溯到我国肉鸡育种的创新进程。2017年,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所与北京LETOU(乐投)技术有限公司共同研发了国内首款自主肉鸡育种SNP芯片——京芯一号55K。


基于“京芯一号”的肉鸡基因组选择技术至今已应用于多家国家级核心育种场,累积检测样本超15万,该芯片的应用加速了我国自主培育白羽肉鸡“广明2号”、黄羽肉鸡“金陵黑凤鸡”、“潭牛文昌鸡”等品种的育成,为打好种业翻身仗提供坚实的技术支撑。然而,随着育种企业对降低成本和提升效率的需求日益迫切,京芯一号mini应运而生。




芯片特点


“京芯一号mini”是基于“京芯一号”55K芯片的位点降维版本,它保留了在不同商业化黄羽、白羽肉鸡的高质量位点,以及与饲料报酬、生长、肉质、胴体、繁殖和抗病等功能位点,与京芯一号55K可以通过填充技术无缝衔接,可应用于基因组选择、亲缘关系判定、遗传多样性评估等工作,实现了遗传评估的高准确性的同时,将基因检测成本降低了40%以上。




芯片应用情况-产品性能


京芯一号mini在不同品系位点多态性表现优异,样本检测率可达99.8%。




芯片应用情况-填充及遗传评估效果


京芯一号mini芯片与京芯一号55K联合使用,不同品系参考面板数量达1000样本时,填充准确性可达98.5%,同时京芯一号mini填充到京芯一号55K芯片进行育种值评估与直接应用京芯一号55K芯片各性状育种值相关性可达99.5%以上。





与“京芯一号mini”相辅相成的是数字化肉鸡联合育种平台。该平台融合了尖端信息技术、计算机科学、数量遗传学和基因组学的最新成果,实现了数据的智能整合、多条件数据质控、多维度个体追踪和精准核心表型提取功能。在开发技术上平台基于Spring Boot框架,采用B/S架构和MySQL数据库技术,将现有基因组选择工作中的样本采集、生产管理、育种管理等环节进行深入融合,实现了企业数据全链条规范管理、多任务协调处理、一键化遗传评估的功能,进一步推进了育种企业的信息化进度。